Некоторые уникальные природные комплексы, которые охраняются в национальных парках Южной Сибири:

• Прибайкальский национальный парк. 1 Здесь сохраняются, например:

• горные каменистые степи Приольхонья, населённые растениями-реликатами; 1

• песчаные дюны острова Ольхон; 1

• пустынные степи окрестностей солёных Тажеранских озёр; 1

• тёмнохвойные кедрово-пихтовые дебри верховьев реки Алтай; 1

• участки тундры и заросли кедрового стланника на водоразделах рек Зундук и Иликта, Кочерикова и Анай. 1

• Национальный парк «Ергаки». 23 Это часть Западных Саян с дикой тайгой, необычными останцами, стремительными реками, водопадами и ледниковыми озёрами. 2

• Национальный парк «Чикой». 4 Здесь охраняются эталонные экосистемы горных степей, кедровых лесов и южно-сибирской тайги в верховьях реки Чикой. 4