Некоторые уникальные геологические особенности Голубых озёр в Приэльбрусье:

• Карстовое происхождение. 25 Озёра образовались в пустотах земной коры, когда мягкие породы, например известняк, с течением времени разрушаются и вымываются. 2
• Большая глубина. 12 Например, глубина Церик-Кёля (Нижнего Голубого озера) достигает 292 метров. 1 На глубине находятся подводные пещеры с расщелинами, которые уходят вглубь земли. 1
• Изменение цвета воды. 5 Озёра приобретают разный оттенок в зависимости от времени года и погоды. 5
• Отсутствие флоры и фауны. 2 В Церик-Кёле практически отсутствуют флора и фауна: в нём живут только мелкие рачки-гаммарусы, а также встречаются скудные водоросли. 2
• Питание реки. 2 Нижнее Голубое озеро питает реку Черек, при этом ни одна река в него не впадает. 2 Учёные предполагают, что озеро подпитывают не просто подземные источники, а настоящая мощная река. 2