Некоторые способы защиты системы от нежелательных изменений через скрытые файлы:

• Использование встроенных средств Windows. 2 Чтобы скрыть папку или файл, нужно включить атрибут «Скрытый» в свойствах соответствующих объектов. 2 Однако такая защита ненадёжна, так как скрытые объекты будут видны в приложениях, которые не используют стандартный диалог для отображения файлов и папок. 2
• Применение шифрованной файловой системы EFS. 2 Для шифрования файлов нужно включить в проводнике опцию «Шифровать содержимое для защиты данных». 2 Прочитать зашифрованные таким способом файлы без знания пароля невозможно. 2
• Использование специализированных утилит. 2 Такие программы позволяют более надёжно скрывать папки и файлы, блокировать доступ к ним и даже шифровать сами данные. 2 Например, Folder Lock, File Lock, Folder Guard. 12
• Комбинация методов. 1 Можно присвоить файлам атрибут «Скрытый» в Windows и одновременно поместить их в зашифрованный контейнер. 1

Для максимальной секретности рекомендуется совмещать несколько способов защиты, а также регулярно создавать резервные копии данных на внешний носитель или в облако. 1