Некоторые редкие виды животных, которые обитают в Мещерском национальном парке и занесены в Красную книгу России: 2

• Гигантская вечерница. 12 Самая крупная в России и Европе летучая мышь. 2
• Русская выхухоль. 12 Небольшой зверёк с густым мехом, узким носиком и хвостом, напоминающим бобровый. 2
• Чёрный аист. 12 Вид, который больше 50 лет считался исчезнувшим из Владимирской области. 2
• Большой подорлик. 34 Одна из самых крупных хищных птиц, отличается однотонным, тёмно-бурым оперением. 4
• Коростель. 3 Редчайший вид луговой птицы, на эмблеме национального парка. 3

К числу редких видов птиц также относятся чернозобая гагара, обыкновенная пустельга, белая куропатка, серый журавль, филин, ушастая сова, удод, трёхпалый дятел и другие. 3