Некоторые редкие виды птиц, которые обитают в Ненецком заповеднике:
- Белощёкая казарка. 1
- Малый лебедь. 14 Это символ заповедника, редкий вид, находящийся под охраной Красной книги России и Ненецкого автономного округа. 4
- Морская чернеть. 1
- Полярная крачка. 1
- Орлан-белохвост. 1
- Кречет. 1
- Дербник. 1
- Зимняк. 1
- Малая и белая чайки. 1
- Сапсан. 1
Всего в заповеднике насчитывается 125 видов птиц, 15 из них занесены в Красную книгу России и Ненецкого автономного округа. 3