Некоторые редкие и охраняемые виды рыб, которые обитают в реке Селенга:
- Байкальский осётр. 25 С 1947 года запрещён для лова на Байкале, занесён в «Красную книгу России» и «Красную книгу Бурятии» как редко встречающийся вид. 5
- Таймень. 24 Хищник, который может достигать огромных размеров, занесён в Красную книгу, поэтому его ловля ограничена. 4
- Ленок. 2 Обычно живёт в крупных реках с течением около двух метров в секунду и галечным или каменистым дном. 1
- Линь. 2 Один из видов, которые включены в Красные Книги разного ранга: Международную, России, Бурятии. 2