На Среднесибирском плоскогорье находятся следующие природные заповедники:

• Центральносибирский. 23 Расположен на западной окраине центральной части плоскогорья и в долине среднего течения Енисея, на территории Эвенкийского района Красноярского края. 3
• Тунгусский. 5 Находится в центральной части плоскогорья, на южной границе вечной мерзлоты, в бассейне реки Подкаменная Тунгуска, в Красноярском крае. 5
• Путоранский. 4 Расположен на плато северо-западной оконечности плоскогорья. 4