На формирование глубоководных впадин в морях влияют различные природные процессы, среди них:

• Тектонические движения. 24 Согласно теории тектоники плит, глубоководные желоба — одна из форм взаимодействия горизонтально движущихся океанических и континентальных плит. 4
• Субдукция. 5 Глубоководный жёлоб образуется в результате продавливания океанической коры под другую океаническую или континентальную кору (схождение плит). 5
• Мантийные струйные течения. 4 Предполагается, что давление над движущейся мантийной струёй меньше, чем давление над окружающей неподвижной мантией. 4 Эта разница давления может приводить к появлению прогиба дна океана и являться вертикально действующей силой, приводящей к возникновению океанических желобов. 4
• Оседание и накопление разрушенных горных пород, которые двигаются под воздействием океанических течений. 2

Также на формирование глубоководных впадин влияют вулканические, эрозионные и осадочные процессы. 2