Некоторые природные препятствия, которые приходилось преодолевать при строительстве Транссибирской магистрали:

• Высокие горы. 2 Например, сложнейший рельеф гор, окружающих котловину Байкала, потребовал годы на изыскания пригодных для прокладки маршрута участков. 5
• Непроходимая тайга. 24 Почти на всём протяжении трасса прокладывалась по малозаселённой или безлюдной местности, в непроходимой тайге. 1
• Могучие сибирские реки. 12 Там, где возможно, через них прокладывали огромные переправы. 2
• Многочисленные озёра. 12 Например, трасса пересекает Волгу, Каму, Обь, Енисей, Иртыш, Амур и ещё с десяток местных речек и озёр. 3
• Районы повышенной заболоченности и вечной мерзлоты. 1 Например, участок от Куэнги до Бочкарево (ныне Белогорск). 1

Исключительные трудности для строителей представлял участок вокруг Байкала (станция Байкал — станция Мысовая). 1 Здесь приходилось взрывать скалы, прокладывать тоннели, возводить искусственные сооружения в ущельях горных речек, впадающих в озеро Байкал. 1