Некоторые природные особенности, которые отличают нагорье Ахаггар от остальной части Алжира:

• Рельеф. Нагорье состоит из вулканических пород, его центральную часть занимает вулканическое поле Атакор с многочисленными конусами, полуразрушенными кальдерами и застывшими лавовыми потоками. 23 В результате выветривания образовались скальные останцы причудливых форм. 2 Поверхность нагорья расчленена сетью вади — сухих долин с временными водотоками. 2
• Климат. Резко континентальный, сухой и жаркий летом, зимой температура иногда падает ниже нуля. 2 Осадки редки. 2 В Ахаггаре самый резкий климат во всей Сахаре, что создаёт особую климатическую зону с видами животных и растений, нехарактерными для остальной части страны. 2
• Флора и фауна. На горных окраинах Ахаггара пустыня уступает место траве, деревьям и даже рощам. 5 Многие виды растений эндемичны и сохранились с неогенового периода оледенения. 5 Животный мир также разнообразен: здесь встречаются песчанки, тушканчики, капские зайцы, эфиопские ежи, гривистые бараны, гепарды, муфлоны, саблерогие антилопы, гиены, шакалы. 5