Повышение концентрации ксенобиотиков в окружающей среде может иметь следующие последствия для экосистем:

• Полное разрушение экосистемы в результате нарушения целостной структуры биотопа и её функций. 1
• Глубокое изменение биотопа. 1 Например, засоление пресноводных биотипов или ухудшение состояния лесов. 1
• Постоянное загрязнение биотопа. 1 Например, эвтрофикация рек и озёр в результате попадания в них значительных количеств биогенных элементов (азот, фосфор). 1
• Массированные загрязнения. 1 Например, загрязнение рек и водоёмов нефтью при авариях танкеров. 1
• Широко распространённое уменьшение видового разнообразия. 1 Например, использование пестицидов и удобрений в агроценозах. 1
• Направленное уничтожение отдельных видов растений и животных. 1 Например, использование пестицидов, в особенности в урбанизированных экосистемах. 1

Также попадание ксенобиотиков в окружающую среду может вызвать повышение частоты аллергических реакций, гибель организмов, изменить наследственные признаки, снизить иммунитет, нарушить обмен веществ, ход процессов в естественных экосистемах вплоть до уровня биосферы в целом. 4