Точные последствия для экосистем Африки из-за исчезновения мух цеце ещё предстоит оценить. 2 Однако есть некоторые факты о влиянии этих насекомых на экосистему континента:

• Сохранение районов обитания крупных диких животных. 4 По мнению зоолога Бернгарда Гржимека, только благодаря мухе цеце в экваториальной Африке сохранились относительно нетронутые человеком районы обитания крупных диких зверей. 24
• Защита почв. 4 Большое количество мух цеце спасло большую часть Африки от перевыпаса и эрозии почв, обычно вызываемой крупным рогатым скотом. 4
• Ограничение экономического развития. 3 На протяжении многих веков люди вынуждены были покидать плодородные долины рек, пригодные для высокопродуктивного сельского хозяйства, чтобы не стать жертвой насекомого. 3
• Влияние на сельское хозяйство. 5 Муха цеце переносит паразитов, которые вызывают истощающую болезнь скота — болезнь «нагана». 5 Это приводит к уменьшению производства мяса и молока, а также к проблемам с выращиванием сельскохозяйственных культур. 5