Некоторые особенности рельефа и дна Истринского водохранилища:

• Наибольшая глубина достигает 23 метров на юге, рядом с плотиной, а на севере чаще встречаются заводи и мелководье. 1
• На протяжении почти всей длины береговой линии присутствуют резкие перепады глубин и обрывы. 1
• В северной части водохранилища чаще встречаются коряжники, особенно на неглубоких участках. 1 На юге дно в основном песчаное, глинистое и илистое. 1
• На дне есть затопленное русло, глубина в области которого может достигать более 10 метров. 1
• Вершины холмов, находившихся в пойме Истры, образовали в акватории лесистые острова и подводные отмели. 3