Кандалакшский залив считается одним из самых глубоких районов Белого моря благодаря следующим особенностям рельефа дна:

• Грабенообразный ров северо-западного простирания. 1 Он замыкается у группы островов (Средние луды) напротив Порьей губы. 1 Далее ров сильно сужается, глубоководная часть превращается в узкую извилистую ложбину, которая простирается до самой кутовой части. 1
• Центральная, наиболее глубоководная часть пролива Великая Салма. 3 Она представляет собой вытянутую в юго-восточном направлении узкую долину шириной до 2 км, углы наклона дна на бортах которой достигают 4–7° (редко больше). 3

Кроме того, в глубоководной впадине залива под рыхлым покровом вскрываются слоистые породы, представленные песчаниками терской свиты рифея. 1