Некоторые особенности реки Колыма, которые делают её важной транспортной артерией для северных регионов России:

• Судоходность. 24 Река судоходна от устья реки Бахапча, регулярное судоходство — от Усть-Среднекана. 2 Продолжительность навигации — 3–3,5 месяцев. 2
• Пересечение с трассой «Колыма» (Якутск — Магадан). 1 Это позволяет завозить грузы по дороге до порта в Сеймчане и уже оттуда развозить их по всем северным посёлкам вдоль реки. 1
• Наличие крупных транспортных узлов. 1 Например, через Сеймчан летом идёт основной грузопоток в низовья якутской части Колымы и окрестности. 1 Крупным транспортным узлом является Зырянка, недалеко от неё добывают уголь, которым отапливают зимой все посёлки на Колыме и на западной Чукотке. 1

Однако неустойчивость русла часто осложняет навигацию: мели и перекаты перемещаются по реке, изменяя фарватер. 4