Основные отличия между длинношёрстным и короткошёрстным чихуахуа заключаются в типе шерсти:

• Длинношёрстные имеют мягкую шелковистую шерсть гладкой или чуть волнистой структуры с небольшим количеством подшёрстка. 6 Наиболее длинный остевой волос растёт в области шеи, ушей, лап, а также задней части конечностей. 6 На шее может быть «меховое жабо». 2
• Короткошёрстные имеют короткую и гладкую шерсть, плотно прилегающую к телу. 67 Более длинная шерсть в зонах шеи и хвоста, самая короткая — на голове и ушах. 6 На животе и горле шерсть более редкая. 9

Таким образом, основное отличие заключается в том, что у длинношёрстных чихуахуа в области живота, груди и хвоста волоски длиннее, как и на ногах и ушах, а у короткошёрстных — шерсть более короткая и плотная. 16