Для очистки малых водоёмов существуют следующие методы:

• Механическая очистка. 3 При первой степени загрязнения достаточно избавиться от мусора с поверхности воды и на глубине. 3 Для этого используют сачки и сетки, а также пылесосы, которые удаляют донные отложения, экскременты рыб и ил. 3
• Химический метод. 4 Заключается в дезинфекции водоёма путём добавления в воду особых реагентов. 4 Различные препараты способны приводить к норме кислотный баланс и уничтожать нежелательную растительность. 4
• Биологический метод. 34 Базируется на биохимических процессах разложения органики, которые помогают стимулировать специальные бактерии. 4 Биодобавки чистят воду от ила и мелких водорослей, насыщают кислородом, поддерживают баланс полезных веществ. 4
• Обработка ультрафиолетом. 4 Ультрафиолетовое излучение используют для уничтожения микроводорослей, микроорганизмов, бактерий и вирусов, находящихся в воде. 4

Для исследования малых водоёмов можно использовать метод биоиндикации. 12 Он основывается на определении количества групп организмов, населяющих водоём. 1 Также для изучения качества воды проводят органолептические исследования, например, определяют прозрачность, мутность, запах, вкус и цвет воды. 2