Для наблюдения и изучения экологического видообразования в природе используются следующие методы:

• Анализ палеонтологической летописи. 2 По ней и измерениям скорости мутаций можно определить, что полная несовместимость геномов, делающая невозможным скрещивание, достигается в природе в среднем за 3 млн лет. 2 Это значит, что наблюдение образования нового вида в естественных условиях возможно, но это крайне редкое явление. 2
• Лабораторные эксперименты. 2 В лабораторных условиях скорость эволюционных изменений может быть увеличена, поэтому есть основания наблюдать видообразование у лабораторных животных. 2 Например, видообразование наблюдалось в лабораторных популяциях комнатных мух, яблонных мух-пёстрокрылок, мучных жуков, комаров и других насекомых. 2

Также для изучения экологического видообразования анализируют динамику специфических условий обитания исходного вида. 4 Например, сезонность воспроизведения потомства, различия в способах питания могут быть причинами видового расхождения. 4