Функции охраны водного района включают:

• Предотвращение, ограничение и устранение последствий загрязнения, засорения и истощения природных вод. 1 Для этого, например, создают водоохранные зоны, очищают поверхностные и подземные воды, очищают сточные воды. 12
• Предупреждение неблагоприятного воздействия вод (наводнения, маловодья, опасные русловые деформации, опасные ледовые явления и др.). 1
• Установление границ водоохранных зон и прибрежных защитных полос поверхностных водных объектов, их обозначение на местности посредством специальных информационных знаков. 3
• Расчистку поверхностных водных объектов от донных отложений. 3
• Аэрацию водных объектов. 3
• Биологическую рекультивацию водных объектов. 3
• Залужение и закрепление кустарниковой растительностью берегов. 3
• Оборудование хозяйственных объектов сооружениями, обеспечивающими охрану поверхностных водных объектов от загрязнения, засорения, заиления и истощения вод. 3

Также охрана водного района включает разработку соответствующих законодательных актов и государственный контроль за использованием и охраной водных ресурсов. 1