Некоторые функции, которые выполняет администрация морских портов:

• Организационное, материально-техническое и финансовое обеспечение исполнения капитанами морских портов функций, предусмотренных законом, другими федеральными законами и нормативными правовыми актами Правительства РФ. 15
• Оказание услуг в морском порту пользователям в соответствии с требованиями закона. 15
• Издание обязательных постановлений в морском порту на русском и английском языках. 1
• Учёт доходов и расходов портовых сборов, в том числе для обеспечения деятельности капитанов морских портов. 1
• Подъём севшего на мель или затонувшего судна для обеспечения безопасности мореплавания или защиты от загрязнения морской среды. 12
• Подъём, удаление или уничтожение затонувшего имущества. 1
• Формирование сведений об операторах морских терминалов на основании письменных заявлений операторов морских терминалов. 12
• Выполнение государственного задания на оказание государственных услуг (выполнение работ), утверждённого Федеральным агентством морского и речного транспорта. 12
• Выполнение плана финансово-хозяйственной деятельности, утверждённого Федеральным агентством морского и речного транспорта. 1
• Взимание портовых сборов в соответствии со ставками портовых сборов и правилами их применения. 12
• Мониторинг перевалки и технологического накопления грузов на морских терминалах, в том числе грузов северного завоза первой и второй категории. 5