Некоторые эндемичные виды животных, которые встречаются только на островах Японии:

• Японский макак. 3 Розовощёкая обезьяна, которую в народе называют «снежной обезьяной». 3 Встречается на всей территории островов Хонсю, Сикоку и Кюсю. 3
• Японский серау. 3 Одиночное лохматое животное, которое часто описывают как нечто среднее между козой и антилопой. 3 Обитает в центральной и северной частях Хонсю и на небольших участках Сикоку и Кюсю. 3
• Ириомотейская кошка. 35 Подвид бенгальской кошки, который обитает исключительно на острове Ириомоте, расположенном на островах Яэяма в префектуре Окинава. 3
• Сима энага. 3 Подвид длиннохвостой синицы, который встречается только на Хоккайдо. 3
• Японская исполинская саламандра. 13 Одна из крупнейших саламандр в мире, часто достигающая полтора метра в длину. 3