Некоторые экологические роли микроскопических грибов в различных экосистемах:

• В почвах. 3 Грибы участвуют в регуляции почвообразовательных процессов, структурировании, установлении температурных характеристик почвы и её кислотности, контролируют структуру и функциональную активность почвенной биоты, состав органического вещества почв. 3
• В водоёмах. 2 Водные сапротрофные грибы играют большую роль в разложении органического вещества в водоёмах и обеспечении детритом водных беспозвоночных и рыб. 2
• На древесине. 2 Грибы, обитающие на древесине (ксилофилы), активно разлагают древесину и древесный опад в лесах, участвуя в круговороте веществ. 2
• В симбиотических отношениях с растениями. 1 На уровне ризосферы растения и грибы вступают в сложные симбиотические отношения, которые выражаются в формировании микоризы. 1
• Как фитопатогены. 34 Многие микроскопические грибы вызывают различные болезни деревьев, кустарников, дикорастущих трав, возделываемых культур, вследствие чего у растений происходит нарушение нормального обмена веществ, приводящее к снижению их продуктивности, а иногда и к гибели. 4

Кроме того, некоторые микроскопические грибы способны разрушать конструктивные и строительные материалы из минеральных компонентов, а также материалы из природных и синтетических полимеров. 1