Некоторые экологические проблемы, возникшие из-за изменения течения реки Сырдарья:

• Опустынивание. 1 Сокращение речного стока, исчезновение весенних паводков и снижение уровня грунтовых вод привели к расширению масштабов опустынивания. 1 На поверхности почвы сформировалась плотная корка из солей, что практически исключило произрастание в таких зонах какой-либо растительности. 1
• Уменьшение площади озёр и водно-болотных угодий. 1 Высыхание дельт привело к существенному уменьшению площади озёр и связанных с ними тростниковых сообществ. 1
• Сокращение числа видов млекопитающих и птиц. 1 Эти процессы содействовали стремительному сокращению видов из-за вымирания уникальных тугайных лесов вдоль основных и второстепенных водотоков. 1
• Загрязнение воды. 35 Качество водных ресурсов в реке ухудшилось из-за сброса засоленных и загрязнённых дренажных вод с орошаемых площадей и остатков агрохимикатов, которые вымываются в дренажные системы и смешиваются с речной водой. 3
• Непригодность воды для питья. 3 Значительная загрязнённость реки как источника питьевого водоснабжения зачастую приводит к росту заболеваемости среди местного населения. 3