Некоторые экологические проблемы, которые могут возникать при взаимодействии растений с животными и грибами:

• Паразитизм. 2 Например, гриб-трутовик разрушает ствол дерева, а повилика, паразитирующая на растениях, нарушает их обмен веществ, ослабляет и нередко вызывает гибель. 2
• Проблемы с опылением растений. 4 Например, отсутствие пчёл может вызвать трудности с опылением и привести к снижению урожайности. 4
• Разрушение природных экосистем. 3 Это может произойти, если у интродуцированных видов нет эффективных механизмов регуляции численности, как, например, у коз и кроликов в Австралии. 3 Чрезмерное размножение таких видов приводит к уничтожению большинства аборигенных видов растений и птиц. 3

Однако есть и положительные аспекты взаимодействия: например, мутуализм (взаимовыгодные отношения) способствует поддержанию биоразнообразия и ускорению круговорота веществ. 4 Так, обработка семян и корней микоризными грибами улучшает рост растений и повышает их устойчивость к заболеваниям. 4