Некоторые экологические проблемы, которые могут возникать при расчистке русел рек:

• Уничтожение нерестилищ. 2 На ряде рек русла, как верховья, так и низовья, являются местами нереста рыб лососёвых пород. 2 Использование тяжёлой техники при расчистке может отразиться на нерестовых кладках. 2
• Загрязнение воды. 2 В реки может попадать количество горюче-смазочных материалов, а также происходить загрязнение, заиление и взмучивание воды. 2 На ней может появляться нефтяная плёнка. 2
• Шум и вибрация. 2 При работе тяжёлой техники производятся шум и вибрация, что может негативно влиять на рыбу. 2
• Мутность воды. 2 Разрытый грунт мутит воду, что также не нравится рыбе. 2

Однако расчистка русел рек может улучшать биологическое состояние водоёмов и условия жизни людей. 5