Некоторые экологические проблемы, которые возникают при переходе от природных биогеоценозов к агроценозам:

• Снижение видового разнообразия. 24 На полях обычно культивируют один или несколько видов растений, что приводит к значительному обеднению видового состава животных, грибов, бактерий. 2
• Неустойчивость экосистемы. 24 Агроценозы не способны к саморегуляции и самовозобновлению, подвержены угрозе гибели при массовом размножении вредителей или возбудителей болезней. 2
• Нарушение круговорота питательных элементов. 23 В естественном биогеоценозе первичная продукция растений (урожай) потребляется в многочисленных цепях питания и вновь возвращается в систему биологического круговорота. 2 В агроценозе такой круговорот элементов резко нарушается, поскольку значительную их часть человек изымает с урожаем. 2
• Потеря плодородия почвы. 3 В связи с постоянным изъятием урожая и нарушением процессов почвообразования, при длительном выращивании монокультуры на культурных землях постепенно происходит снижение плодородия почв. 3
• Деградация земель. 3 Интенсивное ведение сельского хозяйства и обезлесение являются основными причинами деградации земель, связанными с эрозией почв, в результате чего на больших площадях возникает риск потери плодородного верхнего слоя почвы. 3
• Загрязнение окружающей среды. 13 При неправильном ведении сельскохозяйственного производства происходит потеря плодородия почвы, её засоление, опустынивание огромных территорий и загрязнение окружающей среды. 13