Некоторые экологические проблемы, связанные с рекой Маккензи:

• Глобальные изменения климата. 1 Таяние вечной мерзлоты может привести к загрязнению реки и её окрестностей отходами нефте- и газодобычи. 1 Изменения в режиме выпадения и таянии снега — к изменениям высоты воды в весенне-летний и осенне-зимний периоды. 1
• Выбросы метана. 3 Учёные опасаются, что таяние мерзлоты приведёт к значительному росту выбросов метана. 3
• Воздействие ртути. 4 С середины 1980-х годов в водах реки повышается содержание ртути и полихлорированных дифенилов — агентов загрязнения, поступающих в неё издалека. 1