Некоторые экологические проблемы, связанные с распространением комнатных мух в городах:

• Эпидемиологическая опасность. 14 Перелетая с отбросов на продукты питания, мухи могут распространять возбудителей заразных заболеваний, в первую очередь кишечных инфекций. 14
• Антисанитарное состояние населённых мест. 1 Наличие комнатных мух в помещениях, а также во дворах и на улицах свидетельствует о неудовлетворительной очистке территории от бытового мусора и навоза домашних животных. 1
• Завоз мух из неблагополучных по санитарному состоянию районов. 4 Постоянно увеличивающиеся миграционные потоки, недостаточный уровень санитарии во временных жилищах, активное передвижение людей различными видами транспорта, обмен грузами между различными территориями — всё это способствует завозу мух из неблагополучных по санитарному состоянию районов. 4