Некоторые экологические проблемы озера Тургояк:

• Изменение уровня воды. 1 Это приводит к обмелению и зарастанию водоёма. 1 Колебания уровня воды связаны с природными процессами, которые зависят от солнечной активности. 2
• Отходы на дне и в прибрежной полосе. 1 Мусор годами копится и наносит вред как озеру, так и окружающей территории. 1
• Попадание хозбытовых стоков в водоём. 1 Большинство собственников жилых домов и баз отдыха, санаториев, расположенных на берегу озера, используют септики, выгребные ямы или локальные очистные, что не исключает попадания нечистот в озеро. 1
• Избыточная рубка леса. 1 При вырубке используется старая несовершенная техника, которая нарушает почвенный покров и состояние деревьев. 2
• Нарушение системы естественной очистки. 2 Периодическое исчезновение местной речки-стока из озера из-за погодных условий приводит к нарушению системы естественной очистки. 2
• Чрезмерная рекреационная нагрузка. 3 Активное развитие туризма и наплыв отдыхающих на фоне недостаточно развитой инфраструктуры и отсутствия контроля за застройщиками и туристами сказывается на экосистеме озера. 4