Некоторые экологические проблемы в бассейне реки Невы:

• Загрязнение. 3 В результате нерационального использования водных ресурсов и антропогенной нагрузки состав вод реки меняется. 3 Основной фактор — сброс в открытый водный объект коммунальных и ливневых вод промышленных предприятий и населённых пунктов прибрежной зоны Невы. 3
• Развитие сине-зелёных водорослей. 1 В условиях большого количества загрязнений и выбросов природная система очистки воды перестаёт справляться. 1 В таких условиях в воде начинают развиваться водоросли, которые выделяют вредные вещества и продолжают загрязнять водоём. 1
• Загрязнение Невской губы. 4 Колоссальные объёмы бытовых, промышленных и хозяйственных стоков, замутнение взвесью из-за постоянного масштабного строительства, активное судоходство, эрозия береговой линии и загрязнение твёрдым мусором наносят ущерб качеству вод Невской губы и здоровью её биоценозов. 4
• Загрязнение грунтовых вод. 4 Из-за эрозии берегов загрязнённые грунтовые воды попадают в Финский залив без какой-либо очистки. 4

Кроме того, малые реки и каналы в дельте Невы имеют низкую скорость течения, что делает их уязвимыми к антропогенному воздействию. 3