Некоторые экологические последствия, которые могут возникнуть из-за коротких трофических цепей в агроэкосистемах:

• Неустойчивость и неспособность к саморегуляции. 3 Агроэкосистемы требуют постоянного вмешательства человека. 3 Если он не будет поддерживать агроценоз, то последний быстро разрушится и исчезнет: культурные растения, не выдержав конкуренции с природными видами, будут ими вытеснены. 3
• Ослабление защитных механизмов культурных растений. 3 По сравнению с дикорастущими видами у них более слабые защитные механизмы от воздействия вредителей. 3
• Неполный круговорот веществ. 34 Часть минеральных веществ (например, соединения азота, фосфора) выносится с урожаем. 3 Поэтому для восстановления плодородия почвы человек вынужден вносить удобрения. 3