Некоторые экологические последствия аноксигенного фотосинтеза:

• Использование сероводорода в качестве основного донора электронов. 1 Это может происходить в водных или почвенных экосистемах, где в изобилии присутствует сероводород (H2s). 1 Зелёные сернистые бактерии, осуществляющие аноксигенный фотосинтез, окисляют H2s до элементарной серы. 1
• Влияние на продуктивность наземных и водных растений. 4 Аноксигенный фотосинтез используется растениями только для поддержания жизнеспособности уже накопленной биомассы, но не для роста новых тканей. 4 Поэтому учёт доли аноксигенного фотосинтеза важен для оценки продуктивности наземных и водных растений. 4

Кроме того, аноксигенный фотосинтез может иметь и положительные экологические последствия: например, его можно использовать для биотехнологического удаления сероводорода из сточных вод, промышленного или муниципального, а также природного газа или биогаза. 1 Также рассматривается возможность использования захваченной световой энергии для выработки электроэнергии с помощью микробных электрохимических элементов. 1