Загрязнение водоёмов сточными водами способствует размножению сине-зелёных водорослей (цианобактерий) следующим образом:

• Сточные воды являются источником питательных веществ для растений, в основном нитратов и фосфатов. 2 Избыток этих веществ в воде способствует росту водорослей, в том числе цианобактерий. 2
• Отмершие водоросли, попадая на дно, увеличивают содержание фосфора и азота и создают идеальную среду для собственного самовоспроизведения. 5 В результате происходит вторичное загрязнение. 5

Также на увеличение активности сине-зелёных водорослей влияют общее загрязнение окружающей среды, недостаточная очистка сточных вод и повышение температуры воды в результате промышленной деятельности человека. 5