Сброс коммунальных и промышленных сточных вод привёл к сильному загрязнению и эвтрофикации Великих озёр, особенно в заливах. 2

Некоторые негативные последствия такого воздействия:

• Накопление токсических веществ. 3 В озёра поступали соли тяжёлых металлов и хлорорганические соединения, которые накапливались в донных отложениях и водных организмах. 3
• Изменение трофического статуса озёр. 3 Возросла биогенная нагрузка на озёра, особенно фосфорная. 3
• Деградация ихтиофауны. 2 Из некоторых районов побережий Мичигана, Гурона, Верхнего почти исчезли ранее многочисленные популяции норки и выдры. 2
• Появление неместных видов. 4 Примерно каждые восемь месяцев в Великие озёра проникал новый вид, что серьёзно нарушало экосистемы. 4

Для улучшения состояния Великих озёр в 1972 году США и Канада подписали соглашение о качестве воды в озёрах, в котором приняли меры по уменьшению фосфорной нагрузки и сбросу загрязняющих веществ. 13