Некоторые отличия внутренних морей от других типов водоёмов:

• Изоляция от Мирового океана. 12 Внутренние моря большей частью закрыты от сообщения с океаном, у них ограниченный водообмен с ним. 1 Глубина пролива, соединяющего внутреннее море с океаном, небольшая, что ограничивает глубоководные течения. 1
• Влияние впадающих рек на солёность воды. 23 Если внутреннее море получает из речных стоков и осадков больше пресной воды, чем теряет от испарения, то солёность в нём меньше, чем в Мировом океане. 23 Такие моря называют бассейнами разбавления, они обычно находятся в регионах с влажным климатом. 23
• Влияние на гидрологический режим. 2 Если внутреннее море теряет больше пресной воды, чем получает, то солёность в нём выше, чем в Мировом океане. 23 Такие моря называются бассейнами концентрации. 23
• Влияние на фауну и флору. 1 Обособленность внутренних морей по сравнению с открытым океаном, различие условий на относительно ограниченных пространствах и отличия в геологических историях развития обуславливают более высокий эндемизм фауны и в некоторых местах — большее биоразнообразие. 1