Гидрологические изменения могут негативно влиять на экосистему реки Кубань. 3 Из-за гидрологических особенностей и климатических условий акватория меняет свою полноту. 3

Некоторые последствия таких изменений:

• Подтопление и паводки. 23 В период чрезмерных осадков и увлажнения происходит разлив реки, который приводит к подтоплению населённых пунктов. 3 Из-за излишнего количества воды изменяется растительный состав сельскохозяйственных угодий, происходит затопление грунта. 3
• Изменение русел рек. 2 Паводки приводят к постоянному изменению русел рек, обрушению берегов и образованию новых аллювиальных отложений, которые в дальнейшем зарастают древесно-кустарниковой растительностью. 2
• Негативное влияние на нерестилища рыб. 3 Различные режимы водных течений негативно влияют на нерестилища рыб. 3

Кроме того, из-за гидрологических изменений и деятельности человека в реку попадают вредные вещества, что также влияет на экосистему. 24 Длительное действие загрязняющих веществ приводит к упрощению экосистемы, обеднению видового состава животного и растительного мира. 4