Вечная мерзлота влияет на течение реки Лена следующим образом:

• Слабое грунтовое питание. 1 Из-за вечной мерзлоты грунтовое питание либо отсутствует, либо очень слабое. 1 Вода пополняется за счёт таяния льда, снегов, обильных осадков и притоков. 1
• Перемерзание и маловодье в зимний период. 1 Дельта Лены покрывается льдом с конца сентября. 1
• Ускорение русловой эрозии. 15 Деградация вечной мерзлоты приводит к таянию льдов, что в свою очередь способствует большему поступлению наносов в реку. 15 Твёрдые частицы грунтов подхватываются водами в большом количестве и «утаскиваются» вниз по течению. 1