Исток реки Миссисипи, озеро Айтаска, влияет на некоторые природные характеристики реки, например:
- Характер течения. 2 В верховьях река проходит по скалистой местности, русло порожистое, течение бурное. 2 Далее русло более пологое, но с высокими склонами. 2 В нижней части реки течение спокойное и медленное. 2
- Источники питания. 2 В верхней части притоки, стекающие со Скалистых гор, питают реку летом в период таяния снегов. 2 Зимой в этой части река покрыта льдом. 2 В средней части, располагаясь южнее, река льдом не покрывается никогда, а питание получает от дождей. 2
- Флора и фауна. 5 Миссисипи пересекает несколько природных зон, поэтому имеет богатую видами флору и фауну. 5 Наибольшее количество видов рыб встречается в верховьях реки. 5