Капибара ведёт себя в воде следующим образом:

• Отлично плавает и ныряет. 23 Лапы животного оснащены перепонками, что позволяет ему легко передвигаться в воде. 1 Кроме того, внушительная жировая прослойка помогает капибаре удерживаться на поверхности воды. 2
• Способна находиться под водой до пяти минут. 1 Это даёт ей возможность избегать хищников и искать пищу на дне водоёмов. 1 Ноздри и уши капибары расположены высоко на голове, что позволяет ей дышать и слышать, находясь почти полностью погружёнными в воду. 1
• В воде животные находятся, плотно прижавшись друг к другу. 2 При этом взрослые особи располагаются по краям группы, а молодняк — в центре, тем самым организуется дополнительная защита детёнышам. 2

Также вода играет важную роль в социальном поведении капибар: совместные купания помогают укреплять связи внутри группы. 1