Тектоническая впадина Афар влияет на климат и экосистему Африки следующим образом:

Климат в Афарской котловине жаркий и засушливый. 1 Большая часть года проходит без осадков, количество осадков за год составляет 100–200 мм. 1 При приближении к побережью их количество уменьшается. 1

Экосистема впадины характеризуется как пустынная. 2 Растительность представлена засухоустойчивыми растениями: небольшими деревьями (например, драконье дерево), кустарниками и травами. 2 Животные представлены видами, устойчивыми к условиям пустыни: зебра Греви, газели, бейза, а также последний ареал африканских диких ослов. 1

Река Аваш, которая пересекает юг Афарской котловины, является зелёной полосой жизни для флоры, фауны и местного населения. 1