Течение Гумбольдта влияет на климат в прибрежных районах Перу и Чили следующим образом: охлаждает морской воздух и не способствует образованию осадков, что приводит к засушливости пустыни Атакама на севере Чили и прибрежных районов Перу. 13

На биологическое разнообразие течение Гумбольдта влияет следующим образом: благодаря подъёму глубинных вод, которые поднимают наверх растворённые фосфор и азот, на поверхности океана успешно развивается животный и растительный планктон. 2 Он служит пищей для мелкой рыбы, которая, в свою очередь, становится жертвой более крупных рыб, птиц и множества морских млекопитающих. 2

Кроме того, в течении Гумбольдта обитает широкий спектр организмов, включая множество видов планктона, моллюсков, морских ежей, ракообразных, рыб и морских млекопитающих. 1