Строительство и эксплуатация объектов в водоохранной зоне могут повлиять на неё следующим образом: привести к загрязнению, засорению, заилению и истощению водных объектов. 24

Некоторые примеры такого влияния:

• Работа плавсредств и гидромеханизмов. 1 Может стать источником загрязнения акватории нефтепродуктами и их производными. 1 В результате загрязнения нефтью изменяются физические, химические и органолептические свойства воды, ухудшаются условия обитания в ней организмов и растительности. 1
• Использование техники и автотранспортных средств. 1 Для соблюдения режима водоохранной зоны передвижение технических средств нужно ограничивать рамками производственной необходимости. 1 Срезаемый при строительстве растительный грунт необходимо складировать на временной площадке за пределами водоохранной зоны. 1

Чтобы минимизировать негативное влияние, объекты в водоохранной зоне должны быть оборудованы специальными сооружениями, которые защищают водные объекты от загрязнения. 14 К ним относятся канализации, ливнеотводы, колодцы, дренажные установки, системы очистки воды и другие. 4

Кроме того, строительство и реконструкция объектов капитального строительства требуют согласования с территориальными органами Федерального агентства по рыболовству. 23 Решение оформляется в виде заключения, которое содержит условия и ограничения, необходимые для предупреждения или снижения негативного воздействия на водные биологические ресурсы и среду их обитания. 23