Сейши могут оказывать негативное влияние на порты и прибрежные территории, в частности, по следующим причинам:

• Возникновение сильных течений. 14 В бухтах с большими периодами сейш (несколько десятков минут и более) появляются течения, которые опасны для больших судов, заходящих в порт или покидающих его. 1
• Образование тягуна. 13 Короткопериодные сейшевые колебания (с периодами до 5 минут) могут быть причиной тягуна — сильных возвратно-поступательных движений воды. 1 Это приводит к ударам судов о причалы или друг о друга, обрыву швартовых, затруднению или полному прекращению погрузочно-разгрузочных операций. 3
• Наводнения. 1 Сейши могут вызывать значительный подъём уровня жидкости в прибрежной зоне и приводить к наводнениям. 1
• Опасность для прибрежных строений и проживающих по берегам людей. 2 Это возможно, если периоды сейш близки к периодам приходящих на вход бухты волн (цунами). 2

Таким образом, сейши могут создавать риски для работы портов и безопасности прибрежных территорий.