Сельское хозяйство влияет на сокращение рыбных популяций в водоёмах следующим образом:

• Изменение ландшафта прибрежной зоны. 1 Характер растительности влияет на гидрологический и гидрохимический режим водоёма, что сказывается на процессах в его биоценозе и в конечном счёте — на рыбопродуктивности. 1
• Смыв удобрений с полей в водоёмы с талыми и дождевыми водами. 3 Сток в воду отходов животноводческих комплексов, накапливание в водоёме избыточного количества биогенных элементов приводят к сильному зарастанию высшей водной растительностью, нитчаткой, сине-зелёными водорослями, что ухудшает условия жизни многих, особенно донных, рыб. 3
• Уменьшение стока рек из-за использования воды сельским хозяйством для орошения земель. 4 Это нарушает не только условия размножения рыб, но и условия их нагула в море. 4