Как секвенирование применяется для мониторинга загрязнения окружающей среды?

Секвенирование применяется для мониторинга загрязнения окружающей среды путём идентификации видов-биоиндикаторов. 1

Для этого из образцов окружающей среды, таких как почва, вода или воздух, извлекают и анализируют фрагменты ДНК. 4 Это позволяет выявлять присутствие видов без непосредственного наблюдения за ними. 4

Некоторые примеры применения секвенирования в экологическом мониторинге:

• Оценка состояния водных экосистем. 1 Для этого используют, например, хирономид — группу биологических индикаторов, которые различаются по реакции на загрязнение. 1 Они особенно полезны в качестве индикаторов загрязнения водной среды в городских районах. 1
• Исследование структуры микробных сообществ. 2 Анализ ДНК помогает определить таксономическую и функциональную структуру микробного сообщества. 2
• Обнаружение редких и неуловимых видов. 4

Секвенирование следующего поколения (NGS) позволяет за один запуск прибора одновременно секвенировать несколько видов во многих образцах, что сокращает время и затраты, связанные с обработкой образцов. 1