Саянские горы влияют на климат прилегающих территорий следующим образом:

• По Осевому Саянскому хребту проходят границы между областями переноса атлантических и арктических воздушных масс. 1 Это обуславливает обилие осадков на наветренной части северного склона хребта и резкое снижение их количества в подветренной — на южном склоне. 1 Например, наветренные северные склоны и высокогорья заповедника «Саяно-Шушенский» более увлажнены, среднегодовое количество осадков составляет 1235 мм, что определяет широкое развитие лесов. 1 По мере продвижения на юг количество осадков значительно снижается (до 250 мм — 350 мм), и здесь развиваются лесостепи и степи. 1
• Зимой из-за господства сибирского антициклона на территории саянских гор устанавливается сухая холодная, ясная погода. 1
• Летом в северных котловинах наблюдается активная фронтальная циклоническая деятельность, в южных — преобладает жаркая засушливая погода. 2
• Под влиянием рельефа в горах образуется система местных ветров: фёны, склоновые и горно-долинные ветры, ледниковые и другие. 3