С помощью фотограмметрических методов оценивают состояние экосистем следующим образом:

• Создают серии тематических карт на основе суммирования данных, полученных по аэрофотосъёмкам с разноплановой экологической информацией. 1 Точность и детальность метода зависят от качества взаимной привязки и учёта ландшафтных и морфологических особенностей изучаемых территорий. 1
• Используют цифровую наземную стереосъёмку для оценки видового состава растений и исследования закономерностей распространения аэрозолей. 1
• Применяют цифровую технологию стереосъёмки с близких расстояний для детального изучения биоценозов, отдельных живых организмов и структурного анализа различных растений. 1
• Используют стереомикросъёмку для анализа экосистем клеточного уровня, например, изучения формы пыльцевых зёрен и семян различных растений. 2

Также фотограмметрия позволяет осуществлять количественный мониторинг физических (например, структурной сложности: уклон, фрактальная размерность, сложность поверхности) и биологических особенностей (например, покрова бентических сообществ, размера и численности колоний) экосистем с течением времени. 3