Река Шатт-эль-Араб негативно влияет на экосистему Персидского залива. 13

Интенсивное использование её вод на орошение сельхозугодий, производство электроэнергии и осушение болот приводят к разрушению местных экосистем и росту солёности вод. 1 К 2010-м годам она превысила 2 промилле, из сельхозкультур такая вода годится только для самых солестойких сортов финиковой пальмы. 1

Также в реке наблюдается постоянное снижение уровня воды, что способствует увеличению концентрации загрязняющих веществ. 2

Кроме того, солёная вода Персидского залива вытесняет полуостров Фау, опустошая пресноводные рыбные промыслы, домашний скот, посевы и рощи финиковых пальм. 3