Река Нева оказала значительное опресняющее влияние на формирование Финского залива. 13 Её сток, вытекающий из Ладожского озера, и других впадающих в залив рек, например Луги и Плюссы, способствует снижению солёности воды. 1

По мере уменьшения влияния речного стока в направлении с востока на запад, уровень солёности воды в Финском заливе постепенно возрастает. 1 Солоноватые воды в виде клина движутся в восточном направлении, а пресная вода распространяется по поверхности залива в западном направлении. 1

Кроме того, речной сток Невы влияет на колебания уровня воды в Финском заливе. 4

Также строительство защитных сооружений от наводнений города Санкт-Петербург (дамбы) привело к сокращению водообмена Невской губы с восточной частью Финского залива на 10–20% и увеличению концентрации биогенных веществ в Невской губе. 25