Разрушительные наводнения негативно влияют на прибрежные экосистемы следующим образом:

• Загрязнение водных ресурсов. 2 В воду попадают частицы почвы и растений с затопленных территорий, а также смываются мусор и загрязнения с городских, промышленных и селитебных территорий. 1 Особую опасность представляют аварийные разливы токсичных химических веществ, нефти и нефтепродуктов. 1
• Гибель животных. 1 Во время наводнения гибнут многие крупные млекопитающие, так как большие расстояния до берега иногда оказываются непосильными даже для хорошо плавающих животных. 1 Также значительно сокращается численность птиц, гнездящихся в зарослях камышей и тростников. 1
• Нарушение миграций животных. 1 Затопленные территории становятся препятствием на путях миграций животных, например диких копытных. 1
• Эрозия почвы. 2 Верхний слой почвы, содержащий питательные вещества, может быть унесён вместе с водой. 2 Это приводит к уменьшению плодородия почвы и к созданию проблем для сельскохозяйственного сектора. 2

Однако есть и положительное влияние наводнений на экосистемы: если поток воды не оставляет пятен загрязнения и затопления природных ресурсов, то плодородность почвы может значительно повыситься из-за отложения богатого органического материала. 2